Du 5 au 23 janvier 2009, Nausicaa se refait une beauté. Réouverture le samedi 24 janvier, avec au programme :
L’ exposition permanente : La Plage du Tropical Lagoon qui accueille désormais des tortues géantes d’Aldabra, atoll de l’archipel des Seychelles. Les visiteurs peuvent ainsi découvrir de grosses tortues terrestres qui ont naturellement trouvé leur place dans la partie tropicale de l’exposition. Non loin du lagon, sous les cocotiers, elles trouvent chaleur et ombre qui conviennent à leur mode de vie.
La descente vers les tropiques se dote d’un nouveau paysage.
L’espace d’exposition de photos précédant le Plateau d’animation se trouve également transformé.
D’autre part, le centre de Boulogne-sur-mer développe quatre thèmes qui se succéderont tout au long de l’année pour permettre à chacun de tout connaître sur l’Océan. A l’affiche cette année, les requins, les abysses, les baleines, et la consommation responsable de produits de la mer.